Uma parte fundamental do desenvolvimento das novas ideias de Darwin se deve ao método científico-empírico que o cientista aplicou de modo rigoroso. Ele foi um homem diligente ao observar e recolher dados. É impressionante a quantidade de casos observados presentes nas páginas dos seus livros e que são apresentados para confirmar suas teorias. Mas é ainda mais digno de nota sua disposição para reconhecer os erros de suas hipóteses de partida, quando não comprovadas pelos dados observados. Para muitos, Darwin foi um exemplo de aplicação do modelo e da atitude científica, ou seja, acuradamente empírico, anti-dogmático e aberto a novas hipóteses. Nesse sentido, diz-se que foi um “evolucionista” também na sua abordagem científica: muitas hipóteses surgem, só poucas sobrevivem ao impacto do ambiente e da verificação e são selecionadas para dar origem a novas teorias.